Es la entidad encargada de vigilar la conducta de quienes desempeñan funciones públicas, ejerce el poder disciplinario y protege los derechos humanos y asegura su efectividad y lo hace a través de sus tres (3)  funciones que son: Función Preventiva "Prevenir antes de sancionar", Función de Intervención .Interviene ante las jurisdicciones contencioso administrativa, constitucional, penal, civil, ambiental y agraria, de familia, laboral, ante el Consejo Superior de la Judicatura y las autoridades administrativas y de política y la  Función Disciplinaria , encargada de iniciar, adelantar y fallar las investigaciones por faltas disciplinarias de los servidores públicos y particulares que ejercen funciones públicas o manejen dineros del estado. Es el máximo organismos del Ministerio Publico, conformado además por la Defensoría del Pueblo y las Personerías.

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La Contraloria General del Quindio ejerce el control fiscal en el departamento del Quindio en 11 municipios; en las entidades descentralizadas del departamento; Hospitales del Departamento del Quindio. La mision de la CGQ en cumplimiento del mandato constitucional y legal, vigila la gestiòn fiscal y ambiental de los sujetos de control, con transparencia y visibilidad, en procura del correcto manejo de los recursos administrados por las entidades pùblicas, reconociendo a la ciudadania como principal destinataria de su gestiòn.